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三問中國人類蛋白質(zhì)組計劃

[2014/9/28]

  前不久,歷經(jīng)多年論證、被譽為我國生命科學研究領(lǐng)域里程碑事件的中國人類蛋白質(zhì)組計劃(簡稱CNHPP)正式在京啟動,來自清華大學、北京大學、中國科學院、軍事醫(yī)學科學院、解放軍總醫(yī)院、復(fù)旦大學等40多所高校、科研機構(gòu)的近百名專家,共同見證了這一歷史性時刻。

  蛋白質(zhì)組計劃和基因組計劃有何不同?中國的蛋白質(zhì)組研究在國際上處于什么位置?中國人類蛋白質(zhì)組計劃將如何進行?

  圍繞上述問題,筆者獨家采訪了有關(guān)專家。

  一問為什么要搞中國人類蛋白質(zhì)組計劃?

  生,源于基因組;命,卻一定由蛋白質(zhì)組決定。只有蛋白質(zhì)組才能從根本上闡釋生命

  相比“蛋白質(zhì)組”,“蛋白質(zhì)”一詞更為人們所熟知。它是生物體內(nèi)一種極為重要的高分子有機物,占人體干重的54%,1838年由荷蘭科學家格里特首先發(fā)現(xiàn)。

  基于此,1994年,澳大利亞科學家率先提出“蛋白質(zhì)組”,意指某個時刻,某個組織、器官或個體中所有蛋白質(zhì)的集合,是一個整體的概念。

  科學家們之所以對蛋白質(zhì)組產(chǎn)生濃厚興趣,還得從人類基因組計劃說起。2003年4月,經(jīng)由6國科學家歷時13年奮戰(zhàn)的人類基因組計劃畫上了句號。

  “科學界曾經(jīng)認為,只要繪制出人類基因組序列圖,就能了解疾病的根源。但我們錯了。“國際蛋白質(zhì)組組織首任主席薩姆哈納什說,事實上,我們只了解10%基因的功能,剩下的90%仍是未知的。

  “人們總以為蛋白質(zhì)組計劃是基因組計劃的附庸或者說是子產(chǎn)品,這也是一個誤區(qū)。人類基因組計劃并不像事前所預(yù)期的那樣,能夠逾越蛋白質(zhì)這一生物功能去揭示人類生、老、病、死的全部秘密,基因組序列只是提供了一維遺傳信息,而更復(fù)雜的多維信息則發(fā)生在蛋白質(zhì)組層面�!眹H人類蛋白質(zhì)組計劃執(zhí)委、亞太蛋白質(zhì)組組織主席、中國科學院院士賀福初說,基因組和蛋白質(zhì)組的關(guān)系,好比詞典與文章、元素表與化工廠。

  “基因組學中微小的差異,在蛋白質(zhì)組學中可以被千倍甚至近萬倍地放大,想要解密基因組,必須先系統(tǒng)認識蛋白質(zhì)組�!辟R福初認為。

  他舉例說,人體各個器官如耳、鼻、喉、心、肝、肺,其基因組完全相同,不同的是蛋白質(zhì)組。因此,不同器官形態(tài)、功能各異,是蛋白質(zhì)組在背后“操盤”。

  “就像蛹化蝶,無論形態(tài)如何變化,基因組是不變的�!避娛箩t(yī)學科學院放射與輻射醫(yī)學研究所研究員錢小紅這樣比喻。在她看來,人的每一種生命形態(tài),都是特定蛋白質(zhì)組在不同時間、空間出現(xiàn)并發(fā)揮功能的結(jié)果。比如,某些蛋白質(zhì)表達量偏離常態(tài)的高或低,就能夠表征人體可能處于某種疾病狀態(tài)。

  “生,源于基因組;命,卻一定由蛋白質(zhì)組決定。只有蛋白質(zhì)組才能從根本上闡釋生命�!辟R福初進一步解釋道,“蛋白質(zhì)組,可以揭示疾病的發(fā)病機制和病理過程,發(fā)現(xiàn)新型診斷標志物、治療和創(chuàng)新藥物,可以全面提高疾病防診治水平。這個項目如完成,將揭示人體器官蛋白質(zhì)組的構(gòu)成,一旦哪一部位出現(xiàn)異常即可實現(xiàn) ‘GPS定位’,進而找到針對性的診斷措施、干預(yù)措施和預(yù)防措施�!�

  二問中國能搞人類蛋白質(zhì)組計劃嗎?

  以賀福初院士為代表的中國蛋白質(zhì)組研究團隊,在該領(lǐng)域向世界交上了一份漂亮的答卷,在某些方面已走在全球前列

  近代以來,中國先后錯過了多次世界科技革命的機遇。蛋白質(zhì)組學研究,恰恰是我國生命科學中少數(shù)幾個能夠始終躋身世界前沿的科學領(lǐng)域。

  據(jù)專家介紹,中國人類蛋白質(zhì)組事業(yè)的發(fā)展,也催生了一系列大型研究基地和覆蓋全國的協(xié)作網(wǎng)絡(luò)。據(jù)不完全統(tǒng)計,目前包括中科院、教育部、衛(wèi)生計生委、軍隊以及湖南、廣東、重慶、浙江等在內(nèi)的省部級重點實驗室已超過10個。由賀福初院士發(fā)起,以軍事醫(yī)學科學院、清華、北大為代表的7家單位共同籌建的北京蛋白質(zhì)組研究中心,于2005年被確立為“人類肝臟蛋白質(zhì)組計劃”國際執(zhí)行總部,成為一座世界級的“生命之都”。

  此外,自2000年至2010年,中國累計發(fā)表論文2800多篇,位列全球該領(lǐng)域第四。值得一提的是,最近4年,中國在該領(lǐng)域發(fā)文量直線上升,歷史性地達到1000多篇,年度論文發(fā)表數(shù)已躍居世界第二(第一為美國),位居全國其他學科前列。

  歷經(jīng)十余年的努力,中國蛋白質(zhì)組研究團隊向世界交上了一份漂亮的答卷:成功構(gòu)建迄今國際上質(zhì)量最高、規(guī)模最大的人類第一個器官——肝臟蛋白質(zhì)組的表達譜、修飾譜、連鎖圖及其綜合數(shù)據(jù)庫;首次實現(xiàn)人類組織與器官轉(zhuǎn)錄組和蛋白質(zhì)組的全面對接;在炎癥誘發(fā)腫瘤等方面,發(fā)現(xiàn)一批針對肝臟疾病、惡性腫瘤等重大疾病的潛在藥靶、蛋白質(zhì)藥物和生物標志物。如,2008年,張學敏課題組首次發(fā)現(xiàn)炎癥和免疫的新型調(diào)控分子CUEDC2,可作為腫瘤耐藥的新標志物,從而為克服癌細胞耐藥提供了原創(chuàng)性的藥物新靶點和治療新思路。2010年,周鋼橋課題組“逮到”肝癌的易感基因,為肝癌的風險預(yù)測和早期預(yù)警提供了重要理論依據(jù)和生物標記……上述幾項成果均發(fā)表于國際頂級的《科學》《自然》系列雜志。

  三問中國人類蛋白質(zhì)組計劃怎樣進行?

  將分三個階段進行,計劃產(chǎn)生的大數(shù)據(jù)將全景式地揭示人體蛋白質(zhì)組成及其調(diào)控規(guī)律,解讀人類基因組這部“天書”

  世界蛋白質(zhì)組學領(lǐng)域內(nèi)的新一輪科技競賽已開始。中科院院士張玉奎指出,雖然中國在蛋白質(zhì)組一些領(lǐng)域走在了世界前列,但國外有些團隊如今正快馬加鞭。這警醒我們:必須加快步伐,否則很快將被甩出第一陣營。

  “逆水行舟不進則退,我們絕不能喪失已經(jīng)取得的優(yōu)勢�!辟R福初說。

  據(jù)悉,中國人類蛋白質(zhì)組計劃將分三個階段展開。第一階段,全面揭示肝癌、肺癌、白血病、腎病等十大疾病所涉及主要的組織器官的蛋白質(zhì)組,了解疾病發(fā)生的主要異常,進而研制診斷試劑、篩選藥物,力爭2017年左右完成;第二階段,爭取覆蓋中國人的其他常見疾病,提升中國人群疾病的防治水平;第三階段,實現(xiàn)人類更多疾病的覆蓋。

  當前,全球每年產(chǎn)生的生物數(shù)據(jù)總量高達EB級(10的18次方比特),生命科學領(lǐng)域正在爆發(fā)數(shù)據(jù)革命。生物數(shù)據(jù)最大的是基因組數(shù)據(jù),它完成后,蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)無疑將成為更大、更重要和更核心的科學數(shù)據(jù)。我國已部署建設(shè)的蛋白質(zhì)科學基礎(chǔ)設(shè)施將相繼投入運行,這是國際上最大的蛋白質(zhì)組學研究基地,將有力支撐和推動中國人類蛋白質(zhì)組計劃的實施和大數(shù)據(jù)的產(chǎn)生。中國人類蛋白質(zhì)組計劃產(chǎn)生的大數(shù)據(jù)將全景式地揭示人體蛋白質(zhì)組成及其調(diào)控規(guī)律,解讀人類基因組這部“天書”。

  “這項計劃,是以中國重大疾病的防治需求為牽引,發(fā)展蛋白質(zhì)組研究相關(guān)設(shè)備及關(guān)鍵技術(shù),繪制人類蛋白質(zhì)組生理和病理精細圖譜、構(gòu)建人類蛋白質(zhì)組‘百科全書’,為提高重大疾病防診治水平提供有效手段和中國生物醫(yī)藥產(chǎn)業(yè)發(fā)展提供原動力。”賀福初說,“我們首先看重科學價值,其次才是經(jīng)濟效益,因為這是真正的原始創(chuàng)新,是中國能夠引領(lǐng)世界科技發(fā)展的重要領(lǐng)域之一�!�