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熒光PCR的分析方法

[2012/2/13]

  對熒光定量PCR結(jié)果的分析方法我們分為兩種:絕對定量分析法和相對定量分析法。

  1、絕對定量分析方法,起始濃度的對數(shù)跟循環(huán)數(shù)的線性關(guān)系,標準曲線由已知拷貝數(shù)的標準品繪制,根據(jù)樣品的Ct值,可求樣品的模板量。

  (1)標準品的制備:

  1V的樣品原液(i)+9V稀釋緩沖液,得到ii;

  1V的ii +9V稀釋緩沖液,得到iii;

  1V的iii + 9V稀釋緩沖液,得到iv;

  1V的iv +9V稀釋緩沖液,得到v。

  (2)拷貝數(shù)的計算:待測樣本濃度(ng/ul)=OD260×40*稀釋倍數(shù)

  樣品分子量+堿基數(shù)×324

  待測樣本拷貝數(shù)=待測樣本濃度/樣本分子量×6×1014

  從擴增數(shù)據(jù)得到循環(huán)數(shù),通過標準曲線,我們可以求出樣品的拷貝數(shù)。

  2.相對定量分析方法:

  其又可有雙標準曲線法和雙Ct法。所謂相對,就只是實驗前后結(jié)果的對比,反映了反應(yīng)前后的數(shù)據(jù)的差值。

  (1)雙標準曲線法,分析簡單,但是對于每一個基因,每一輪實驗都需要做標準曲線,而且必須有特定的標準品作標準曲線,這樣的標準品不代表樣品擴增的真實狀態(tài)。這種方法常用于基因表達調(diào)控。

  F=待測樣品目的基因濃度/待測樣品參照基因濃度÷對照樣品目的基因濃度/對照樣品參照基因濃度

  (2)雙Ct法,此方法不用對看家基因和目的基因做標準曲線,而只需要對待測樣品分別進行PCR擴增即可,標準曲線的差值<0.1.假若擴增效率為100%或標準曲線及每次擴增之間的效率都保持一致,這樣實驗條件優(yōu)化較難為復(fù)雜。這種分析方法較長用于基因表達調(diào)控研究中。